各都道府県で指定されている特定不妊治療、助成対象医療機関は約600クリニックです。 そのうちアンケートなどに協力していただける約400クリニックとのネットワークがあり、 約160クリニックでフリーマガジンを配布していただいています。
約50クリニックは「ジネコ応援ドクター」として、インタビューやセカンドオピニオンなど、ジネコ運営のサポートをしていただいています。ジネコ応援ドクターの来院患者数は、不妊治療患者の約60%程度を占めています。